Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC117090L7N257 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms