Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms