Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms