Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm2035J3QP87 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm2035J3QP87 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms