Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms