Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms