Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc180J3QNE4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc180J3QNE4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms