Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms