Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms