Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20825J3QM67 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20825J3QM67 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20825J3QM67 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20825J3QM67 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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