Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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