Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21411J3KMS0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms