Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21863J3KMP8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms