Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AK157302I3ITR1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms