Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Taf4bG5E8Z2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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