Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcf11G3X9Z4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms