Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3tc1G3X9F6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms