Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms