Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28038F7BCN9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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