Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf212F6TQD1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf212F6TQD1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf212F6TQD1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf212F6TQD1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnf212F6TQD1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnf212F6TQD1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf212F6TQD1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf212F6TQD1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf212F6TQD1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf212F6TQD1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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