Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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