Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Urb2E9Q7L1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms