Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc85cE9Q6B2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc85cE9Q6B2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85cE9Q6B2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms