Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms