Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DspE9Q557 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DspE9Q557 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DspE9Q557 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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