Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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