Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3095E9Q058 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms