Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc1E9Q043 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms