Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms