Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5415E9PXF3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5415E9PXF3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms