Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms