Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc17E9PVB5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms