Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms