Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp839E9PUU5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms