Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syde2E9PUP1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms