Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga1E1U8D0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Soga1E1U8D0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms