Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cngb1E1AZ71 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms