Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm5478D3Z6R0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5478D3Z6R0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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