Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6685D3YYP3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6685D3YYP3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms