Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kif28pD3YXS5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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