Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx8D3YU81 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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