Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2B9EJA2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms