Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms