Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms