Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cfap58B2RW38 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms