Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms