Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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