Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms