Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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