Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfx1B1AY10 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms